مطالعه فیلوژنتیکی ویروس انفلوآنزا a، ساب تایپ h۵n۱ ، در همسایگان ایران طی سال های ۲۰۰۶-۲۰۰۳

زمینه و اهداف: ساب تایپ h5n1 ویروس انفلوآنزا، که با قدرت کشندگی بالا می باشد، در سال های اخیر باعث تلفات زیادی در منطقه آسیا و به ویژه در کشورهای آسیای شرقی و خاور میانه شده است. هدف این مطالعه تعیین فیلوژنتیک ویروس انفلوآنزا a، ساب تایپ h5n1 ، در همسایگان ایران طی سال های 2006-2003 بود. روش بررسی: از الگوریتم های بیوانفورماتیکی همترازی سکانس ها استفاده شد. سکانس های ژنی و پروتئینی ژن هماگلوتینین ساب تایپ h5n1 ویروس انفلوآنزا که در بانک های ژنی و پروتئینی کشور های همسایه ایران گزارش شده بود، استخراج شد و مورد بررسی و تجزیه و تحلیل قرار گرفت. یافته ها: بین سال های 2006-2003، از بروز عفونت انفلوآنزا ساب تایپ h5n1 در کشورهای همسایه ایران 237 گزارش به بانک ژنوم (genbank) گزارش شده بود. پس از بررسی 64 مورد سکانس غیر تکراری استخراج شد. در نهایت 64 سکانس ژن و پروتئین هماگلوتینین با استفاده از الگوریتم بیوانفورماتیکی clustal و نرم افزارهای clustalw و mega4 سکانس ژنومی و اسیدآمینه بررسی و تجزیه و تحلیل شد. سرانجام درخت فیلوژنتیکی این ویروس ها تعیین گردید. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی ژن هماگلوتینین نشان داد که این ویروس از مرز های شمالی کشور به ویژه روسیه و کشور های تازه استقلال یافته آسیای میانه وارد ایران شده است. سپس از منطقه شمالی در داخل کشور گسترش یافته است. نتیجه گیری: ویروس انفلوانزای نوع h1n1 از طریق کشورهای همسایه شمالی وارد کشور ایران شده است.